BT - Unet:生物医学图像分割的自监督学习框架

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BT-Unet采用Barlow twin方法对U-Net模型的编码器进行无监督的预训练减少冗余信息,以学习数据表示。之后,对完整网络进行微调以执行实际的分割。,BT-Unet由 Indian Institute of Information Technology Allahabad开发,发布在2022年的JML上。,2023030613091434171ba30b72ae0ef07367ab9c1cf279d9819c127,BT-Unet架构图:a、预训练U-Net编码器网络,b、用预训练的编码器权值初始化的微调U-Net模型,BT-Unet框架分为两个阶段:1)预训练阶段和2)微调阶段。,预训练的目的是使用无注释的数据样本,学习复杂的特征表示。U-Net模型的编码器使用Barlow Twins (BT)策略进行预先训练,然后进行微调以执行实际的分割:,20230306130529355af2992f2993be847335e6f6c5a1fe4ab5ad703,BT-Unet框架可应用于各种先进的U-Net模型:经典U-Net、注意力U-Net (A-Unet)、inception U-Net (I-Unet)和residual cross-spatial attention guided inception  U-Net (RCA-IUnet)。,U-Net 模型中编码器网络的权重使用预训练权重(来自第一阶段)进行初始化,而网络的其余部分使用默认权重进行初始化。,使用有限的注释样本对 U-Net 模型进行微调,用于生物医学图像分割。,U-Net 模型使用分段损失函数进行微调,L 定义为二元交叉熵损失、LBC 和dice coefficient损失的平均值,LDC:,20230306130529d2c1f121456c2ac4e48528b4cc76444ea4f0d5804,其中,y为像素的真值标签,p(y)为像素的预测标签,N为像素的总数量。,论文使用下面的数据集进行评测对比:,2023030613052909d0c8352fbf37417167764d5d534aaba20e41729,基于相同样本数量的小训练集的性能分析,2023030613052955c4dbb26e4588e486e6879e5ac3c96dd6ab3d927,20230306130915e1c4aa66852c8b114dd5016e72306b68be6699720,20230306141336099a68955fbdaf7f2a4807b76831aca93b43e2576,对于所有训练数据比例小于50%的数据集,在模型之间观察到类似的性能变化。,2023030613091653cff57636a0c2052e75410a7294b4b5a24260953,带有BT的RCA-IUNet具有很好的分割效果。

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